Efter at opnå titlten som den yngste rider i historien, tog hans sejren i Red Bull Grand Prix i USA. Han tog styringen i sporten og vise både en stor mængde attitude og sjælden stil.
The Circuit of the Americas was their first victory in MotoGP
Hurtige seks år senere overtog Márquez verdensmester i det japanesiske Grand Prix. En tæt konkurrent var Andrea Dovizioso, som endte med at stå et skridt nærmere jorden på podiet.
2008 og 2009: Verdensmesterskaberne og rejsen dertil
Det tog ikke lang tid for Márquez at blive en del at eliten og ende på podiet. Til hans sjette race tog han en podieplds til det britiske GP i Donington. På hans bare 15 år og 137 dage, blev han den første spanske rider på podiet til verdensmesterskabet. Efter endt kampagne, havde han kørt 13 ud af 17 runder.
I sæsonen 2010, teamede Márquez op med Derbi team. Efter hans viste høj pace blev han for alvor en af favoritterne til at vinde titlen som 'verdens bedste rider'.
Da mesterskabet endelig var nær, havde Márquez allerede vundet 10 sejre og startet fra polen 11 gange. Den sidste runde var i Valencia og Márquez vandt sig en fjerde plads. Det gav ham sammenlagt en titel som den bedste rider på verdensplan. Han var nu på vej mod Moto1 som klasse 125cc verdensmester.
Ankomsten til Qatar til runde 1, kendte man ikke til det fulde omfang af Márquez' tilstand. Han fjernede dog enhver tvivl, da han tog sejren, og beviste at hans form for resten af sæsonen var umatchelig.
Der var et par kontroverser undervejs med kritik fra andre ryttere og endda sanktioner fra FIM, men med ni sejre og i alt 14 podieplaceringer fra 17 GP's var Márquez en værdig mester.
Det var midtvejs gennem sæsonen, kort efter Casey Stoners bekræftede pensionering fra MotoGP i slutningen af 2012, at Márquez blev annonceret som Dani Pedrosas Repsol Honda holdkammerat i MotoGP for 2013...
2013: MotoGP debut sæson (6 sejrer)
Marquez's MotoGP success kicked off at the Circuit of the Americas in 2013
Márquez vandt det næste løb på Circuit of the America og fortsatte med at vinde fem løb til. Han hævdede sin første MotoGP-titel i den sidste runde af serien, og slog Jorge Lorenzo med 34 point og blev den første rookie siden Kenny Roberts i 1978.
Den spanske rytter vandt de første ti løb i sæsonen i en uafbrudt vinder-streak. Streakeb varede fra marts til september 2014. Márquez tog sin anden titel med Honda med massive 67 point foran Valentino Rossi.
I en sæson fuld af kollisioner og sammenstød mellem Márquez, Rossi og Lorenzo gav det ikke et hat-trick for titler, og Márquez måtte nøjes med at komme på tredjepladsen.
Márquez genvandt sin MotoGP-krone med sin femte sejr i sæsonen til den japanske Grand Prix, da hans hårde titlerivaler Lorenzo og Rossi begge styrtede og måtte udgå.
På trods af en stærk start fra Andrea Dovizioso på Ducati, stemplede Márquez sin autoritet fast på MotoGP-mesterskabet midt i sæsonen med en række af back-to-back-sejre i Tyskland og Tjekkiet. Han ville fortsætte med at vinde tre mere, efterhånden som udfordringen fra Doviziosos forsvandt.
I sæsonens sidste løb i Valencia havde Dovizioso brug for at vinde og se Márquez blive 11. eller lavere for at blive mester. Men da Dovizioso styrtede ned af sin Ducati, forseglede Márquez sin fjerde MotoGP-titel på hjemmebane i Valencia.
